A Junta de Missões Nacionais da IPB (JMN), desde 1940, tem como objetivo alcançar o país com o Evangelho de Cristo e plantar novas igrejas presbiterianas em território nacional. Atualmente, são mantidos pela JMN 188 missionários em 185 campos. Sendo 50 missionários exclusivos da JMN IPB e 138 em parcerias. Os resultados colhidos por esse trabalho são bastante significativos.

A JMN inicia trabalhos evangelísticos e planta novas igrejas em cidades em que os presbitérios e igrejas locais da IPB encontram dificuldades para abrir uma igreja. Outra preocupação da JMN se resume em formar parcerias com os presbitérios e igrejas locais, analisando os dados sociais e econômicos da região para assim iniciar o trabalho de evangelização e plantação de novas igrejas.

A Junta de Missões Nacionais é composta pelos seguintes dirigentes:

• Presidente : Presb. Vicente Lúcio Gouveia de Deus
• Vice Pres. : Rev. Adilson Maciel de Araújo
• Secretário : Rev. Eber Pinheiro Viana

Titulares

• Presb. Vicente Lucio Gouveia de Deus – BA
• Presb. Airton Costa de Sousa – PI
• Rev. Adilson Maciel de Araujo – MT
• Rev. Juan Gustavo Medina – SC
• Rev. Marcos Severo do Amorim – RN
• Rev. Hamilton Rodrigues da Silva – ES
• Rev. Jonas Zulske – SP
• Rev. Paulo Emilio Rocha Reis – RJ
• Presb. Pb. Gilberto Oliveira Camargo – SP

Suplentes

• Rev. Jorge Lolla – BA
• Rev. Aramilson da Silveira Salazar – CE
• Presb. Sostenes Aranha – DF